Obec leží v západnej časti sprašovej Nitrianskej pahorkatiny na strednom toku Radošinky pri sútoku s Hlavinkou. Malé Ripňany sú významná archeologická lokalita. V intraviláne obce sú evidované nálezy z obdobia praveku, stredoveku a novoveku. Najvýznamnejšie polohy sú Od Obsolovského, Za Kolárom, Severný okraj obce, Balažiková roľa a cesta medzi Malými Ripňanmi a Biskupovou.
